Affymetrix公司研制了全球首张基因芯片，发表顶级杂志最好最多，最受国际认可，市场份额最高，是最知名的芯片公司。

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人甲基化芯片2.1M,人全基因组甲基化芯片,Human DNA Methylation 2.1M Whole-Genome Tiling - 10 Array Set

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应用Rat Gene2.0芯片全转录组基因表达芯片，可对大鼠进行基因水平、外显子水平及可变剪切分析。

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HumanCVD BeadChip

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细胞周期甲基化PCR芯片用于研究参与细胞周期调控的22个关键基因的启动子甲基化状态。利用这个芯片分析细胞或新鲜组织基因组DNA样本可能有助于关联CpG岛甲基化状态与生物表型。

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粘性连接PCR芯片可用于研究粘性连接作用相关的84个关键基因的表达。

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该芯片可以检测约23,000个牛的转录子，对应19,000个同源基因。

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细胞衰老PCR芯片可用于研究细胞衰老生物过程的84个关键基因的表达。衰老细胞通常呈现大而扁平的细胞外观，与其他细胞接触少，且细胞外基质粘附性增加。在分子层面，细胞衰老过程激活p53和pRb信号通路，

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illumina公司的全基因组分型芯片为研究者提供了一个广谱的全基因组范围的疾病研究工具。

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