在细胞内，几乎所有的生物过程都离不开蛋白质与配体的相互作用（protein-ligand interactions）。这些配体可以是小分子药物、代谢物、脂类、甚至金属离子。深入理解这些相互作用不仅有助于揭示信号通路、调控机制和疾病机制，更是药物发现、靶点验证以及机制研究的关键一步。然而，蛋白-配体相

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无标记定量蛋白质组学（Label-free Quantitative Proteomics, LFQ）因其样本准备简便、适用范围广、成本相对较低，成为当前生物医学研究中的主流定量策略。然而，LFQ数据质量和重复性问题始终是制约其应用深度和可靠性的关键因素。在本文中，我们将系统解析影响LFQ数据表现的

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无标记定量蛋白质组学（Label-Free Quantitative Proteomics）作为研究生物系统中蛋白表达动态变化的重要工具，已广泛应用于疾病机制研究、药物靶点发现及生物标志物筛选。在无标记定量策略中，数据依赖采集（Data-Dependent Acquisition, DDA）与数据独

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蛋白质翻译后修饰（Post-Translational Modifications, PTMs）在调控细胞功能、信号转导、代谢过程及疾病发生中扮演着核心角色。磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等修饰形式，为蛋白质赋予了时空特异性和功能多样性，是理解蛋白功能状态的重要线索。随着质谱技术的发展，数据独立采集

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在生命科学研究和生物医学领域，蛋白质的定量分析对于理解生物过程、发现疾病标志物及开发新型疗法具有重要意义。多反应监测（Multiple Reaction Monitoring, MRM）作为基于质谱技术的高特异性、高灵敏度定量方法，已成为目标蛋白质定量分析的重要工具。 一、多反应监测（MRM）技术

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在蛋白组学研究中，样本复杂性是影响数据质量的关键因素。无论是组织样本、体液样本，还是固定保存的临床材料，其共同特点都是蛋白种类繁多、丰度跨度大、干扰物多，给蛋白质识别和定量带来巨大挑战。数据非依赖采集（DIA）技术虽然具备高重现性和高通量，但在面对复杂背景时仍存在蛋白识别率偏低、低丰度蛋白难以覆盖等

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Circular Dichroism（CD）光谱是一种基于手性分子对圆偏振光选择性吸收的光谱学技术，广泛应用于蛋白质二级结构的快速定性和定量分析。相比X射线晶体学或核磁共振等高分辨方法，CD光谱具有快速、无需结晶、样品消耗低等显著优势，特别适用于蛋白质结构初筛、构象变化监测及蛋白质稳定性评估。在本文

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蛋白质是生命活动的执行者，其一级结构（氨基酸序列）决定了其功能。要研究蛋白质的结构与功能，首先必须了解其氨基酸组成和排列顺序。因此，蛋白质测序成为现代生命科学研究和生物医药开发中的关键步骤。而在众多测序方法中，Edman降解（Edman degradation）被誉为蛋白质一级结构解析的&ldquo

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引言：精准识别N端序列，为蛋白研究打下基础 在蛋白质研究中，氨基酸序列的精确鉴定是理解其功能与结构的第一步。虽然现代质谱技术已在蛋白质组学领域大放异彩，但在某些特定场景下，一种经典的序列分析方法依然不可或缺——Edman降解（Edman degradation）。这种以化学方

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在抗体药物的研发过程中，蛋白质序列的准确解析是确保药物功能与安全性的核心环节。然而，抗体分子N末端的化学修饰或结构异常（即“N末端阻断”）常导致传统测序技术失效，这一问题已成为抗体开发领域长期存在的技术瓶颈。Edman降解作为一种经典的N端测序方法，凭借其独特的化学特性，在应

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